perinatologyРоссийский вестник перинатологии и педиатрииRossiyskiy Vestnik Perinatologii i Pediatrii (Russian Bulletin of Perinatology and Pediatrics)1027-40652500-2228Ltd. “The National Academy of Pediatric Science and Innovation”10.21508/1027-4065-2023-68-2-69-73perinatology-1803Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИORIGINAL ARTICLESКишечная микробиота при хронических заболеваниях печени у детейGut microbiota in chronic liver diseases in childrenhttps://orcid.org/0000-0002-5413-9599ВолынецГ. В.VolynetsG. V.

Волынец Галина Васильевна — доктор медицинских наук, главный научный сотрудник, рук. отдела гастроэнтерологии Научно-исследовательского клинического института педиатрии и детской хирургии им. академика Ю.Е. Вельтищева, профессор кафедры инновационной педиатрии и детской хирургии факультета дополнительного профессионального образования Российского национального исследовательского медицинского университета им. Н.И. Пирогова

125412 Москва, ул. Талдомская, д. 2

Moscow

volynec_g@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0001-8837-9243НикитинА. В.NikitinA. V.

Никитин Артем Вячеславович — кандидат медицинских наук, ведущий научный сотрудник отдела гастроэнтерологии Научно-исследовательского клинического института педиатрии и детской хирургии им. академика Ю.Е. Вельтищева, врач–детский гастроэнтеролог отделения гастроэнтерологии Морозовской детской городской клинической больницы, ассистент кафедры гастроэнтерологии факультета дополнительного профессионального образования Российского национального исследовательского медицинского университета им. Н.И. Пирогова

125412 Москва, ул. Талдомская, д. 2

Moscow

https://orcid.org/0000-0002-6525-8665СкворцоваТ. А.SkvortsovaT. A.

Скворцова Тамара Андреевна — кандидат медицинских наук, ведущий научный сотрудник отдела гастроэнтерологии Научно-исследовательского клинического института педиатрии и детской хирургии им. академика Ю.Е. Вельтищева; доцент кафедры 2 гастроэнтерологии факультета дополнительного профессионального образования Российского национального исследовательского медицинского университета им. Н.И. Пирогова, заведующая отделением гастроэнтерологии Морозовской детской городской клинической больницы; гл. внештатный детский специалист-гастроэнтеролог Департамента здравоохранения города Москвы

125412 Москва, ул. Талдомская, д. 2

Moscow

https://orcid.org/0000-0003-4905-2373ПотаповА. С.PotapovA. S.

Потапов Александр Сергеевич — доктор медицинских наук, профессор, главный научный сотрудник, заведующий гастроэнтерологическим отделением с гепатологической группой 

119296 Москва, Ломоносовский просп., д. 2

Moscow

https://orcid.org/0000-0002-6271-5218ДудуричВ. В.DudurichV. V.

Дудурич Василиса Валерьевна — руководитель отдела «Микробиом» лаборатории

199106 Санкт-Петербург, Большой проспект Васильевского острова, д. 90, корп. 2

Saint Petersburg

https://orcid.org/0000-0002-4479-3095ДаниловЛ. Г.DanilovL. G.

Данилов    Лаврентий    Глебович    —    биоинфрматик    лаборатории «СЕРБАЛАБ», лаборант-исследователь кафедры генетики и биотехнологии Санкт-Петербургского государственного университета

199106 Санкт-Петербург, Большой проспект Васильевского острова, д. 90, корп. 2

Saint Petersburg

Научно-исследовательский клинический институт педиатрии и детской хирургии им. академика Ю.Е. Вельтищева ФГАОУ ВО РНИМУ им. Н.И. Пирогова Минздрава России; ФГАОУ ВО «Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова» Минздрава РоссииРоссияVeltischev Research and Clinical Institute for Pediatrics and Pediatric Surgery of the Pirogov Russian National Research Medical University; Pirogov Russian National Research Medical UniversityRussian FederationНаучно-исследовательский клинический институт педиатрии и детской хирургии им. академика Ю.Е. Вельтищева ФГАОУ ВО РНИМУ им. Н.И. Пирогова Минздрава России; ФГАОУ ВО «Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова» Минздрава России; ГБУЗ «Морозовская детская городская клиническая больница ДЗМ»РоссияVeltischev Research and Clinical Institute for Pediatrics and Pediatric Surgery of the Pirogov Russian National Research Medical University; Pirogov Russian National Research Medical University; Morozov Children’s Municipal Clinical HospitalRussian FederationФГАУ «Национальный медицинский исследовательский центр здоровья детей» Минздрава РоссииРоссияNational Medical Research Center for Children’s HealthRussian FederationМедико-генетический центр «СЕРБАЛАБ»РоссияMedical Genetic Center CERBALABRussian FederationМедико-генетический центр «СЕРБАЛАБ»; ФГБОУ ВО «Санкт-Петербургский государственный университет» Минздрава РоссииРоссияMedical Genetic Center CERBALAB; Saint Petersburg State UniversityRussian Federation2023270420236826973Copyright © Ltd. “The National Academy of Pediatric Science and Innovation”, 20232023Ltd. “The National Academy of Pediatric Science and Innovation”Ltd. “The National Academy of Pediatric Science and Innovation”https://www.ped-perinatology.ru/jour/about/submissions#copyrightNoticehttps://www.ped-perinatology.ru/jour/article/view/1803

Влияние кишечной микробиоты на развитие различных заболеваний вызывает огромный интерес исследователей. Однако данные об аксономическом разнообразии кишечной микробиоты при хронических заболеваниях печени у детей отсутствуют. Цель исследования. Изучение таксономического разнообразия кишечной микробиоты у детей с хроническими заболеваниями печени в сравнении с здоровыми пациентами.

Материалы и методы

Материалы и методы. Проведен метагеномный анализ кишечной микробиоты 24 детей с хроническими заболеваниями печени (средний возраст 10,3±4,7 года) с выделением целевого фрагмента гена 16S рРНК. В основную группу вошли 18 детей с аутоиммунными заболеваниями печени и 6 детей с неаутоиммунными заболеваниями печени. Группу сравнения составили 34 условно здоровых ребенка.

Результаты

Результаты. Исследование выявило 684 вида микроорганизмов в исследуемых образцах кала пациентов. Анализ исследований показал, что образцы кала здоровых детей и пациентов с хроническими заболеваниями печени различаются по бактериальному разнообразию. Доминирующим таксоном у здоровых детей были Neisseria flavescens, у пациентов с хроническими заболеваниями печени — Bifidobacterium longum, Bifidobacterium adolescentis, Blautia massiliensis. При этом Bifidobacterium longum, Bifidobacterium adolescentis, Blautia massiliensis в образцах кала пациентов с хроническими заболеваниями печени повышено в 8 раз.

Заключение

Заключение. Выявлены показатели различия в составе кишечной микробиоты у здоровых детей и детей с хроническими заболеваниями печени.

The impact of gut microbiota on the development of various diseases is of great interest to researchers. However, data on the taxonomic diversity of the intestinal microbiota in chronic liver diseases in children are lacking.

Purpose

Purpose. To study the taxonomic diversity of the fecal microbiota in children with chronic liver diseases in comparison with healthy patients.

Material and methods

Material and methods. A metagenomic analysis of the intestinal microbiota of 24 children with chronic liver diseases (mean age 10.3 ± 4.7 years) was carried out with the isolation of the target fragment of the 16S rRNA gene. The group included 18 children with autoimmune liver diseases and 6 children with non-autoimmune liver diseases. The comparison group consisted of fecal samples of 34 apparently healthy children.

Results

Results. The conducted study revealed 684 types of microorganisms in the studied samples of patients’ feces. An analysis of the conducted studies showed that fecal samples of healthy children and patients with chronic liver diseases differ in bacterial diversity. The dominant taxa in healthy children were Neisseria flavescens, in patients with chronic liver diseases, the dominant taxa were Bifidobacterium longum, Bifidobacterium adolescentis, Blautia massiliensis. At the same time, Bifidobacterium longum, Bifidobacterium adolescentis, Blautia massiliensis in fecal samples of patients with chronic liver diseases was 8 times as high.

Conclusion

Conclusion. Studies have shown differences in the composition of the intestinal microbiota in healthy children and children with chronic liver diseases.

детикишечная микробиотахронические болезни печениchildrengut microbiotachronic liver diseaseReferencesXu X.R., Liu C.Q., Feng B.S., Liu Z.J. Dysregulation of mucosal immune response in pathogenesis of inflammatory bowel disease. World J Gastroenterol 2014; 20(12): 3255–3264. DOI: 10.3748/wjg.v20.i12.3255Xu X.R., Liu C.Q., Feng B.S., Liu Z.J. Dysregulation of mucosal immune response in pathogenesis of inflammatory bowel disease. World J Gastroenterol 2014; 20(12): 3255–3264. DOI: 10.3748/wjg.v20.i12.3255Carrière J., Darfeuille-Michaud A., Nguyen H.T. Infectious etiopathogenesis of Crohn’s disease. World J Gastroenterol 2014; 20(34): 12102–12117. DOI: 10.3748/wjg.v20.i34.12102Carrière J., Darfeuille-Michaud A., Nguyen H.T. Infectious etiopathogenesis of Crohn’s disease. World J Gastroenterol 2014; 20(34): 12102–12117. DOI: 10.3748/wjg.v20.i34.12102Abraham C., Cho J.H. Inflammatory bowel disease. N Engl J Med 2009; 361(21): 2066–2078. DOI: 10.1056/NEJMra0804647Abraham C., Cho J.H. Inflammatory bowel disease. N Engl J Med 2009; 361(21): 2066–2078. DOI: 10.1056/NEJMra0804647Kaser A., Zeissig S., Blumberg R.S. Inflammatory bowel disease. Annu Rev Immunol 2010; 28: 573–621. DOI: 10.1146/annurev-immunol-030409–101225Kaser A., Zeissig S., Blumberg R.S. Inflammatory bowel disease. Annu Rev Immunol 2010; 28: 573–621. DOI: 10.1146/annurev-immunol-030409–101225David L.A., Maurice C.F., Carmody R.N., Gootenberg D.B., Button J.E., Wolfe B.E. et al. Diet rapidly and reproducibly alters the human gut microbiome. Nature 2014; 505(7484): 559–563. DOI: 10.1038/nature12820David L.A., Maurice C.F., Carmody R.N., Gootenberg D.B., Button J.E., Wolfe B.E. et al. Diet rapidly and reproducibly alters the human gut microbiome. Nature 2014; 505(7484): 559–563. DOI: 10.1038/nature12820Sonnenburg E.D., Smits S.A., Tikhonov M., Higginbottom S.K., Wingreen N.S., Sonnenburg J.L. Diet-induced extinctions in the gut microbiota compound over generations. Nature 2016; 529(7585): 212–215. DOI: 10.1038/nature16504Sonnenburg E.D., Smits S.A., Tikhonov M., Higginbottom S.K., Wingreen N.S., Sonnenburg J.L. Diet-induced extinctions in the gut microbiota compound over generations. Nature 2016; 529(7585): 212–215. DOI: 10.1038/nature16504Modi S.R., Collins J.J., Relman D.A. Antibiotics and the gut microbiota. Clin Invest 2014; 124(10): 4212–4218. DOI: 10.1172/JCI72333Modi S.R., Collins J.J., Relman D.A. Antibiotics and the gut microbiota. Clin Invest 2014; 124(10): 4212–4218. DOI: 10.1172/JCI72333Maurice C.F., Haiser H.J., Turnbaugh P.J. Xenobiotics shape the physiology and gene expression of the active human gut microbiome. Cell 2013; 152(1–2): 39–50. DOI: 10.1016/j.cell.2012.10.052Maurice C.F., Haiser H.J., Turnbaugh P.J. Xenobiotics shape the physiology and gene expression of the active human gut microbiome. Cell 2013; 152(1–2): 39–50. DOI: 10.1016/j.cell.2012.10.052Sonnenburg J.L., Backhed F. Diet-microbiota interactions as moderators of human metabolism. Nature 2016; 535(7610): 56–64. DOI: 10.1038/nature18846Sonnenburg J.L., Backhed F. Diet-microbiota interactions as moderators of human metabolism. Nature 2016; 535(7610): 56–64. DOI: 10.1038/nature18846Huttenhower C., Gevers D., Knight R., Abubucker S., Badger J.H., Chinwalla A.T. et al. Human Microbiome Project Consortium. Structure, function and diversity of the healthy human microbiome. Nature 2012; 486(7402): 207–214. DOI: 10.1038/nature11234Huttenhower C., Gevers D., Knight R., Abubucker S., Badger J.H., Chinwalla A.T. et al. Human Microbiome Project Consortium. Structure, function and diversity of the healthy human microbiome. Nature 2012; 486(7402): 207–214. DOI: 10.1038/nature11234Gevers D., Kugathasan S., Denson L.A., Vázquez-Baeza Y., Van Treuren W., Ren B. et al. The treatment-naive microbiome in new-onset Crohn’s disease. Cell Host Microbe 2014; 15(3): 382–392. DOI: 10.1016/j.chom.2014.02.005Gevers D., Kugathasan S., Denson L.A., Vázquez-Baeza Y., Van Treuren W., Ren B. et al. The treatment-naive microbiome in new-onset Crohn’s disease. Cell Host Microbe 2014; 15(3): 382–392. DOI: 10.1016/j.chom.2014.02.005Kummen M., Hov J.R. The gut microbial influence on cholestatic liver disease. Liver Int 2019; 39(7): 1186–1196. DOI: 10.1111/liv.14153Kummen M., Hov J.R. The gut microbial influence on cholestatic liver disease. Liver Int 2019; 39(7): 1186–1196. DOI: 10.1111/liv.14153Nakamoto N., Sasaki N., Aoki R., Miyamoto K., Suda W., Teratani T. et al. Gut pathobionts underlie intestinal barrier dysfunction and liver T helper 17 cell immune response in primary sclerosing cholangitis. Nat Microbiol 2019; 4(3): 492– 503. DOI: 10.1038/s41564–018–0333–1Nakamoto N., Sasaki N., Aoki R., Miyamoto K., Suda W., Teratani T. et al. Gut pathobionts underlie intestinal barrier dysfunction and liver T helper 17 cell immune response in primary sclerosing cholangitis. Nat Microbiol 2019; 4(3): 492– 503. DOI: 10.1038/s41564–018–0333–1Liao L., Schneider K.M., Galvez E.J.C., Frissen M., Marschall H.U., Su H. et al. Intestinal dysbiosis augments liver disease progression via NLRP3 in a murine model of primary sclerosing cholangitis. Gut 2019; 68(8): 1477–1492. DOI: 10.1136/gutjnl-2018–316670Liao L., Schneider K.M., Galvez E.J.C., Frissen M., Marschall H.U., Su H. et al. Intestinal dysbiosis augments liver disease progression via NLRP3 in a murine model of primary sclerosing cholangitis. Gut 2019; 68(8): 1477–1492. DOI: 10.1136/gutjnl-2018–316670Волынец Г.В., Никитин А.В., Скворцова Т.А. Кишечный микробном и современные методы его исследования у детей. Российский вестник перинатологии и педиатрии 2022: 67 (4): 5–13. DOI: 10.21508/1027–4065–2022–67–4–5–13Volynets G.V., Nikitin A.V., Skvortsova T.A. Intestinal microbiome and modern methodsof its study in children. Rossiyskiy Vestnik Perinatologii i Pediatrii 2022; 67(4): 5–13. (in Russ.) DOI: 10.21508/1027–4065–2022–67–4–5–13

The authors declare that there are no conflicts of interest present.