perinatologyРоссийский вестник перинатологии и педиатрииRossiyskiy Vestnik Perinatologii i Pediatrii (Russian Bulletin of Perinatology and Pediatrics)1027-40652500-2228Ltd. “The National Academy of Pediatric Science and Innovation”10.21508/1027-4065-2023-68-4-24-XXperinatology-1844Research ArticleОБЗОРЫ ЛИТЕРАТУРЫLITERATURE REVIEWSАнализ РНК как перспективное направление диагностики в нефрологииRNA analysis as a promising area of diagnostics in nephrologyhttps://orcid.org/0000-0002-0942-0103МорозовС. Л.MorozovS. L.

Сергей Леонидович Морозов, к. м. н., вед. науч. сотр.

отдел наследственных и приобретенных болезней почек им. проф. М. С. Игнатовой

125412

ул. Талдомская, д. 2

Москва

Moscow

mser@list.ruhttps://orcid.org/0009-0006-1646-8427ПахомоваВ. П.PakhomovaV. P.

Виктория Павловна Пахомова, лаборант-исследователь

лаборатория клинической геномики и биоинформатики

125412

ул. Талдомская, д. 2

Москва

Moscow

https://orcid.org/0000-0001-8491-0228ВоиноваВ. Ю.VoinovaV. Yu.

Виктория Юрьевна Воинова, д. м. н., зам. дир. по трансляционной медицине, гл. науч. сотр. 

отдел клинической генетики

125412

ул. Талдомская, д. 2

Москва

Moscow

https://orcid.org/0000-0002-0942-0103ДлинВ. В.DlinV. V.

Владимир Викторович Длин, д. м. н., проф., рук. отдела, зам. дир. по научной работе в педиатрии

отдел наследственных и приобретенных болезней почек им. проф. М. С. Игнатовой

125412

ул. Талдомская, д. 2

Москва

Moscow

ОСП «Научно-исследовательский клинический институт педиатрии и детской хирургии им. акад. Ю. Е. Вельтищева» (Институт Вельтищева) ФГАОУ ВО РНИМУ им. Н. И. Пирогова Минздрава России; ФГАОУ ВО «Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н. И. Пирогова» Минздрава РоссииРоссияVeltischev Research and Clinical Institute for Pediatrics and Pediatric Surgery of the Pirogov Russian National Research Medical University; Pirogov Russian National Research Medical UniversityRussian FederationФГАОУ ВО «Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н. И. Пирогова» Минздрава РоссииРоссияPirogov Russian National Research Medical UniversityRussian FederationОСП «Научно-исследовательский клинический институт педиатрии и детской хирургии им. акад. Ю. Е. Вельтищева» (Институт Вельтищева) ФГАОУ ВО РНИМУ им. Н. И. Пирогова Минздрава РоссииРоссияVeltischev Research and Clinical Institute for Pediatrics and Pediatric Surgery of the Pirogov Russian National Research Medical UniversityRussian Federation2023060920236842431Copyright © Ltd. “The National Academy of Pediatric Science and Innovation”, 20232023Ltd. “The National Academy of Pediatric Science and Innovation”Ltd. “The National Academy of Pediatric Science and Innovation”https://www.ped-perinatology.ru/jour/about/submissions#copyrightNoticehttps://www.ped-perinatology.ru/jour/article/view/1844

   В настоящее время традиционные диагностические инструменты не отвечают современным запросам. Методы молекулярной диагностики не только дополняют традиционные методы исследования, но и дают понимание с точки зрения молекулярной патофизиологии. Анализ матричной РНК — новая область, которая может произвести революцию в диагностике и лечении заболеваний почек. Изучение мРНК может быть применимо для диагностики и классифицирования заболеваний почек, прогнозирования прогрессирования нефропатий, контроля эффективности лечения и разработки современных подходов к терапии. Будучи новой областью, анализ мРНК сталкивается с рядом проблем и ограничений, однако с развитием технологий методика становится более доступной для применения в клинической практике.

   Today, medicine is at a stage when traditional diagnostic tools no longer meet current needs, which has led to the rapid development of molecular diagnostic methods that not only complement traditional research methods but also provide insight from the point of view of molecular pathophysiology. mRNA analysis is a new field that could revolutionize the diagnosis and treatment of kidney disease. The study of mRNA can be used for diagnosing and classifying kidney diseases, predicting the progression of nephropathies, monitoring the effectiveness of treatment, and developing modern approaches to therapy. As a new field, mRNA analysis faces a number of challenges and limitations, but as technology advances, the technique becomes more accessible for clinical use.

детинефротический синдроммРНКэкспрессиябиомаркерытранскриптомикаchildrennephrotic syndromemRNAexpressionbiomarkerstranscriptomicsReferencesМорозов С.Л., Длин В.В., Сухоруков В.С., Воронкова А.С. Молекулярная нефропатология: новые возможности диагностики заболеваний почек. Российский вестник перинатологии и педиатрии 2017; 62(3): 32–36. DOI: 10.21508/1027–4065–2017–62–3–32–36Morozov S.L., Dlin V.V., Sukhorukov V.S., Voronkova A.S. Molecular nephropathology: new possibilities for diagnosing kidney diseases. Rossiyskiy vestnik perinatologii i pediatrii 2017; 62(3): 32–36. (in Russ.) DOI: 10.21508/1027–4065–2017–62–3–32–36Морозов С.Л., Воронкова А.С., Длин В.В., Туркина Т.И., Сухоруков В.С. Анализ экспрессии генов по технологии nCounter Nanostring в медицинских исследованиях: опыт использования у детей с нефротическим синдромом. Российский вестник перинатологии и педиатрии 2019; 64(1): 110–115. DOI: 10.21508/1027–4065–2019–64–1–110–115Morozov S.L., Voronkova A.S., Dlin V.V., Turkina T.I., Sukhorukov V.S. Analysis of gene expression using nCounter Nanostring technology in medical research: experience of use in children with nephrotic syndrome. Rossiyskiy vestnik perinatologii i pediatrii 2019; 64(1): 110–115. (in Russ.) DOI: 10.21508/1027–4065–2019–64–1–110–115Neuen B.L., Bello A.K., Levin A., Lunney M., Osman M.A., Ye F. et al. National health policies and strategies for addressing chronic kidney disease: Data from the International Society of Nephrology Global Kidney Health Atlas. PLOS Glob Public Health 2023; 3(2): e0001467. DOI: 10.1371/journal.pgph.0001467Neuen B.L., Bello A.K., Levin A., Lunney M., Osman M.A., Ye F. et al. National health policies and strategies for addressing chronic kidney disease: Data from the International Society of Nephrology Global Kidney Health Atlas. PLOS Glob Public Health 2023; 3(2): e0001467. DOI: 10.1371/journal.pgph.0001467Морозов С.Л., Аксенова М.Е. Первичный нефротический синдром у детей. Перспективы персонализированной терапии. Практическая Медицина 2018; (8): 39–42.Morozov S.L., Aksenova M.E. Primary nephrotic syndrome in children. Prospects for personalized therapy. Prakticheskaya Meditsina 2018; 8: 39–42. (in Russ.)Игнатова М.С., Длин В.В. Нефротический синдром: прошлое, настоящее и будущее. Российский вестник перинатологии и педиатрии 2017; 62(6): 29–44. URL: https://cyberleninka.ru/article/n/nefroticheskiy-sindrom-proshloe-nastoyaschee-i-buduschee?ysclid=lm7k8pcbn0915911031Ignatova M.S., Dlin V.V. Nephrotic syndrome: past, present and future. Rossiyskiy vestnik perinatologii i pediatrii 2017; 62(6): 29–44. (in Russ.) URL: https://cyberleninka.ru/article/n/nefroticheskiy-sindrom-proshloe-nastoyaschee-i-buduschee?ysclid=lm7k8pcbn0915911031Liu K-Z., Tian G., Ko AC-T., Geissler M., Brassard D., Veres T. Detection of renal biomarkers in chronic kidney disease using microfluidics: progress, challenges and opportunities. Biomed Microdevices 2020; 22(2): 29. DOI: 10.1007/s10544–020–00484–6Liu K-Z., Tian G., Ko AC-T., Geissler M., Brassard D., Veres T. Detection of renal biomarkers in chronic kidney disease using microfluidics: progress, challenges and opportunities. Biomed Microdevices 2020; 22(2): 29. DOI: 10.1007/s10544–020–00484–6Длин В.В., Морозов С.Л. Персонализированная терапия в детской нефрологии: проблемы и перспективы. Российский вестник перинатологии и педиатрии 2021; 66(2): 6–12. DOI: 10.21508/1027–4065–2021–66–2–6–12Dlin V.V., Morozov S.L. Personalized therapy in pediatric nephrology: problems and prospects. Rossiyskiy vestnik perinatologii i pediatrii. 2021; 66(2): 6–12. (in Russ.) DOI: 10.21508/1027–4065–2021–66–2–6–12Игнатова М.С., Морозов С.Л., Крыганова Т.А., Шенцева Д.В., Назарова Н.Ф., Конькова Н.Е. и др. Современные представления о врожденных аномалиях органов мочевой системы (синдром CAKUT) у детей. Клиническая нефрология 2013; 2: 58–64.Ignatova M.S., Morozov S.L., Kryganova T.A., Shentseva D.V., Nazarova N.F., Konkova N.E. et al. Modern ideas about congenital anomalies of the urinary system (CAKUT syndrome) in children. Klinicheskaya nefrologiya 2013; 2: 58–64. (in Russ.)Mizdrak M., Kumrić M., Kurir T.T, Božić J. Emerging biomarkers for early detection of chronic kidney disease. JPM 2022; 12(4): 548. DOI: 10.3390/jpm12040548Mizdrak M., Kumrić M., Kurir T.T, Božić J. Emerging biomarkers for early detection of chronic kidney disease. JPM 2022; 12(4): 548. DOI: 10.3390/jpm12040548Reidy K., Kang H.M., Hostetter T., Susztak K. Molecular mechanisms of diabetic kidney disease. J Clin Invest 2014; 124(6): 2333–2340. DOI: 10.1172/JCI72271.Reidy K., Kang H.M., Hostetter T., Susztak K. Molecular mechanisms of diabetic kidney disease. J Clin Invest 2014; 124(6): 2333–2340. DOI: 10.1172/JCI72271.Yan Z., Wang G., Shi X. Advances in the progression and prognosis Biomarkers of chronic kidney disease. Front Pharmacol 2021; 12: 785375. DOI: 10.3389/fphar.2021.785375Yan Z., Wang G., Shi X. Advances in the progression and prognosis Biomarkers of chronic kidney disease. Front Pharmacol 2021; 12: 785375. DOI: 10.3389/fphar.2021.785375Длин В.В., Морозов С.Л. Нефротический синдром: возможна ли персонализированная терапия? Обзор. Педиатрия. Восточная Европа 2023; 11(1): 65–76. DOI: 10.34883/PI.2023.11.1.007Dlin V.V., Morozov S.L. Nephrotic syndrome: Is personalized therapy possible? Review. Pediatriya. Vostochnaya Evropa 2023; 11(1): 65–76. (in Russ.) DOI: 10.34883/PI.2023.11.1.007Морозов С.Л., Коваль Н.Ю., Столяревич Е.С., Пирузиева О.Р., Лепаева Т.В., Никишина Т.А. и др. Волчаночный нефрит как актуальная проблема педиатрической нефрологии. Клинический пример люпус нефрита I класса у ребенка с нефротическим синдромом. Практическая Медицина 2022; 20(2): 13–19.Morozov S.L., Koval N.Yu., Stolyarevich E.S., Piruzieva O.R., Lepaeva T.V., Nikishina T.A. et al. Lupus nephritis as an actual problem of pediatric nephrology. A clinical example of class I lupus nephritis in a child with nephrotic syndrome. Prakticheskaya meditsina 2022; 20(2): 13–19. (in Russ.)Varnell C.D., Stone H.K., Welge J.A. Bleeding complications after pediatric kidney biopsy: A Systematic Review and Meta-Analysis. CJASN. 2019; 14(1): 57–65. DOI: 10.2215/CJN.05890518Varnell C.D., Stone H.K., Welge J.A. Bleeding complications after pediatric kidney biopsy: A Systematic Review and Meta-Analysis. CJASN. 2019; 14(1): 57–65. DOI: 10.2215/CJN.05890518Floege J., Mak R.H., Molitoris B.A., Remuzzi G., Ronco P. Nephrology research — the past, present and future. Nat Rev Nephrol 2015; 11(11): 677–687. DOI: 10.1038/nrneph.2015.152Floege J., Mak R.H., Molitoris B.A., Remuzzi G., Ronco P. Nephrology research — the past, present and future. Nat Rev Nephrol 2015; 11(11): 677–687. DOI: 10.1038/nrneph.2015.152Molecular biology of the cell. 5<sup>th</sup> ed. Editor: B. Alberts New York: Garland Science; 2008: 1392.Molecular biology of the cell. 5<sup>th</sup> ed. Editor: B. Alberts New York: Garland Science; 2008: 1392.Crick F.H. The genetic code--yesterday, today, and tomorrow. Cold Spring Harb Symp Quant Biol 1966; 31: 1–9.Crick F.H. The genetic code--yesterday, today, and tomorrow. Cold Spring Harb Symp Quant Biol 1966; 31: 1–9.Moore M.J., Proudfoot N.J. Pre-mRNA processing reaches back to transcription and ahead to translation. Cell 2009; 136(4): 688–700. DOI: 10.1016/j.cell.2009.02.001Moore M.J., Proudfoot N.J. Pre-mRNA processing reaches back to transcription and ahead to translation. Cell 2009; 136(4): 688–700. DOI: 10.1016/j.cell.2009.02.001Van De Vrie M., Deegens J.K., Eikmans M., Van Der Vlag J., Hilbrands L.B. Urinary MicroRNA as Biomarker in Renal Transplantation. Am J Transplant 2017; 17(5): 1160–1166. DOI: 10.1111/ajt.14082Van De Vrie M., Deegens J.K., Eikmans M., Van Der Vlag J., Hilbrands L.B. Urinary MicroRNA as Biomarker in Renal Transplantation. Am J Transplant 2017; 17(5): 1160–1166. DOI: 10.1111/ajt.14082Li B., Hartono C., Ding R., Sharma V.K., Ramaswamy R., Qian B. et al. Noninvasive diagnosis of renal-allograft rejection by measurement of messenger RNA for perforin and granzyme B in urine. N Engl J Med 2001; 344(13): 947–954. DOI: 10.1056/NEJM200103293441301Li B., Hartono C., Ding R., Sharma V.K., Ramaswamy R., Qian B. et al. Noninvasive diagnosis of renal-allograft rejection by measurement of messenger RNA for perforin and granzyme B in urine. N Engl J Med 2001; 344(13): 947–954. DOI: 10.1056/NEJM200103293441301Mas V.R., Dumur C.I., Scian M.J., Gehrau R.C., Maluf D.G. MicroRNAs as biomarkers in solid organ transplantation. Am J Transplant 2013; 13(1): 11–19. DOI: 10.1111/j.1600–6143.2012.04313.xMas V.R., Dumur C.I., Scian M.J., Gehrau R.C., Maluf D.G. MicroRNAs as biomarkers in solid organ transplantation. Am J Transplant 2013; 13(1): 11–19. DOI: 10.1111/j.1600–6143.2012.04313.xilflingseder J., Reindl-Schwaighofer R., Sunzenauer J., Kainz A., Heinzel A., Mayer B. et al. MicroRNAs in kidney transplantation. Nephrol Dial Transplant 2015; 30(6): 910–917. DOI: 10.1093/ndt/gfu280ilflingseder J., Reindl-Schwaighofer R., Sunzenauer J., Kainz A., Heinzel A., Mayer B. et al. MicroRNAs in kidney transplantation. Nephrol Dial Transplant 2015; 30(6): 910–917. DOI: 10.1093/ndt/gfu280Zhang W., Yi Z., Keung K.L., Shang H., Wei C., Cravedi P. et al. A peripheral blood gene expression signature to diagnose subclinical acute rejection. JASN [Internet] 2019; 30(8): 1481–1494. DOI: 10.1681/ASN.2018111098Zhang W., Yi Z., Keung K.L., Shang H., Wei C., Cravedi P. et al. A peripheral blood gene expression signature to diagnose subclinical acute rejection. JASN [Internet] 2019; 30(8): 1481–1494. DOI: 10.1681/ASN.2018111098Woroniecka K.I., Park A.S.D., Mohtat D., Thomas D.B., Pullman J.M., Susztak K. Transcriptome analysis of human diabetic kidney disease. Diabetes 2011; 60(9): 2354–2369. DOI: 10.2337/db10–1181Woroniecka K.I., Park A.S.D., Mohtat D., Thomas D.B., Pullman J.M., Susztak K. Transcriptome analysis of human diabetic kidney disease. Diabetes 2011; 60(9): 2354–2369. DOI: 10.2337/db10–1181Kalantari S., Nafar M. A comprehensive narrative review of diagnostic biomarkers in human primary membranous nephropathy. Biomark Med 2017; 11(9): 781–797. DOI: 10.2217/bmm-2017–0081Kalantari S., Nafar M. A comprehensive narrative review of diagnostic biomarkers in human primary membranous nephropathy. Biomark Med 2017; 11(9): 781–797. DOI: 10.2217/bmm-2017–0081Морозов С.Л. Особенности экспрессии генов иммунной системы при стероидрезистентном нефротическом синдроме. Российский вестник перинатологии и педиатрии 2018; 63(4): 221–222. DOI: 10.21508/1027–4065-congress-2018Morozov S.L. Peculiarities of immune system gene expression in steroid-resistant nephrotic syndrome. Rossiyskiy vestnik perinatologii i pediatrii 2018; 63(4): 221–222. (in Russ.) DOI: 10.21508/1027–4065-congress-2018Youssef D.M., Elbehidy R.M., Abdelhalim H.S., Amr G.E. Soluble interleukine-2 receptor and MDR1 gene expression levels as inflammatory biomarkers for prediction of steroid response in children with nephrotic syndrome. Iran J Kidney Dis 2011; 5(3): 154–161.Youssef D.M., Elbehidy R.M., Abdelhalim H.S., Amr G.E. Soluble interleukine-2 receptor and MDR1 gene expression levels as inflammatory biomarkers for prediction of steroid response in children with nephrotic syndrome. Iran J Kidney Dis 2011; 5(3): 154–161.Морозов С.Л., Воронкова А.С., Длин В.В. Значение экспрессии гена ABCB1 у детей с идиопатическим нефротическим синдромом. Нефрология 2021; 25(1): 83–89. DOI: 10.36485/1561–6274–2021–25–1–83–89Morozov S.L., Voronkova A.S., Dlin V.V. Significance of ABCB1 gene expression in children with idiopathic nephrotic syndrome. Nefrologiya 2021; 25(1): 83–89. (in Russ.) DOI: 10.36485/1561–6274–2021–25–1–83–89Donn R., Berry A., Stevens A., Farrow S., Betts J., Stevens R. et al. Use of gene expression profiling to identify a novel glucocorticoid sensitivity determining gene, BMPRII. FASEB J 2007; 21(2): 402–414. DOI: 10.1096/fj.06–7236comDonn R., Berry A., Stevens A., Farrow S., Betts J., Stevens R. et al. Use of gene expression profiling to identify a novel glucocorticoid sensitivity determining gene, BMPRII. FASEB J 2007; 21(2): 402–414. DOI: 10.1096/fj.06–7236comEikmans M., Baelde H.J., De Heer E., Bruijn J.A. Messenger RNA assessment in clinical nephrology: perspectives and progress of methodology. Nephrol Dialys Transplant 2005; 20(12): 2598–2601. DOI: 10.1093/ndt/gfi176Eikmans M., Baelde H.J., De Heer E., Bruijn J.A. Messenger RNA assessment in clinical nephrology: perspectives and progress of methodology. Nephrol Dialys Transplant 2005; 20(12): 2598–2601. DOI: 10.1093/ndt/gfi176Shao О., Yang H., Zhuang X., Liao J., Yang P., Cheng J. et al. scDeepSort: a pre-trained cell-type annotation method for single-cell transcriptomics using deep learning with a weighted graph neural network. Nucleic Acids Res 2021; 49(21): e122–e122. DOI: 10.1093/nar/gkab775Shao О., Yang H., Zhuang X., Liao J., Yang P., Cheng J. et al. scDeepSort: a pre-trained cell-type annotation method for single-cell transcriptomics using deep learning with a weighted graph neural network. Nucleic Acids Res 2021; 49(21): e122–e122. DOI: 10.1093/nar/gkab775Камышова Е.С., Бобкова И.Н., Кутырина И.М. Современные представления о роли микрорнк при диабетической нефропатии: потенциальные биомаркеры и мишени таргетной терапии. Сахарный диабет 2017; 20(1): 42–50. DOI: 10.14341/DM8237Kamyshova E.S., Bobkova I.N., Kutyrina I.M. Modern ideas about the role of microRNAs in diabetic nephropathy: potential biomarkers and targets for targeted therapy. Saharnyi diabet 2017; 20(1): 42–50. (in Russ.) DOI: 10.14341/DM8237Mengel M., Loupy A., Haas M., Roufosse C., Naesens M., Akalin E. et al. Banff 2019 Meeting Report: Molecular diagnostics in solid organ transplantation–Consensus for the Banff Human Organ Transplant (B-HOT) gene panel and open source multicenter validation. Am J Transplant 2020; 20(9): 2305–2317. DOI: 10.1111/ajt.16059Mengel M., Loupy A., Haas M., Roufosse C., Naesens M., Akalin E. et al. Banff 2019 Meeting Report: Molecular diagnostics in solid organ transplantation–Consensus for the Banff Human Organ Transplant (B-HOT) gene panel and open source multicenter validation. Am J Transplant 2020; 20(9): 2305–2317. DOI: 10.1111/ajt.16059

The authors declare that there are no conflicts of interest present.