perinatologyРоссийский вестник перинатологии и педиатрииRossiyskiy Vestnik Perinatologii i Pediatrii (Russian Bulletin of Perinatology and Pediatrics)1027-40652500-2228Ltd. “The National Academy of Pediatric Science and Innovation”10.21508/1027-4065-2025-70-1-11-17perinatology-2133Research ArticleОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫREVIEWSПолногеномное секвенирование для выявления однородительских дисомийWhole-genome sequencing for the identification of uniparental disomyhttps://orcid.org/0009-0000-7015-1208СучкоП. А.SuchkoP. A.

Сучко Павел Александрович - магистрант

Санкт-Петербург

Surgut

Saint-Petersburg

https://orcid.org/0000-0002-0191-7342ДаниловаА. А.DanilovaA. A.

Данилова Александра Артемовна - мл. науч. сотр., асп.

Санкт-Петербург

Saint-Petersburg

https://orcid.org/0009-0008-3282-5521ПинковскаяЕ. В.PinkovskayaE. V.

Пинковская Екатерина Викторовна - лаборант-исследователь; студентка

628403 Сургут, пр. Ленина, д. 1

Санкт-Петербург

Surgut

Saint-Petersburg

https://orcid.org/0000-0002-0091-2224ГлотовО. С.GlotovO. S.

Глотов Олег Сергеевич - д.б.н., зав. отделом экспериментальной медицинской вирусологии, молекулярной генетики и биобанкинга; ст. науч. сотр.

197022 Санкт-Петербург, ул. Профессора Попова, д. 9

Saint-Petersburg

https://orcid.org/0000-0002-4479-3095ДаниловЛ. Г.DanilovL. G.

Данилов Лаврентий Глебович - асп.; мл. науч. сотр.

Сургут

Санкт-Петербург

Surgut

Saint-Petersburg

БУ ВО Ханты-Мансийского автономного округа - Югры «Сургутский государственный университет»; ФГБОУ ВО «Санкт-Петербургский государственный университет»РоссияSurgut State University; Saint Petersburg State UniversityRussian FederationФГБОУ ВО «Санкт-Петербургский государственный химико-фармацевтический университет» Минздрава РоссииРоссияSaint-Petersburg State Chemical and Pharmaceutical UniversityRussian FederationФГБУ «Детский научно-клинический центр инфекционных болезней Федерального медико-биологического агентства России»; ФГБНУ «Научно-исследовательский институт акушерства, гинекологии и репродуктологии им. Д.О. Отта»РоссияPediatric Research and Clinical Center for Infectious Diseases; Ott Research Institute of Obstetrics, Gynecology and ReproductologyRussian Federation2025050320257011117Copyright © Ltd. “The National Academy of Pediatric Science and Innovation”, 20252025Ltd. “The National Academy of Pediatric Science and Innovation”Ltd. “The National Academy of Pediatric Science and Innovation”https://www.ped-perinatology.ru/jour/about/submissions#copyrightNoticehttps://www.ped-perinatology.ru/jour/article/view/2133

Однородительские дисомии хромосом — вид хромосомных вариаций, при которых обе гомологичные хромосомы или хромосомные области наследуются от одного родителя. Такие вариации зарегистрированы для всех хромосом. Частота однородительских дисомий составляет 1 случай на 2000 родов. Причины возникновения однородительских дисомий включают ошибки в ходе мейоза, постзиготические ошибки, робертсоновские и реципрокные транслокации. Клинические проявления связаны с потерей гетерозиготности по патогенным генетическим вариантам и дефектами геномного импринтинга.В настоящее время диагностика однородительских дисомий осуществляется с использованием таких методов, как микросателлитный анализ, хромосомный микрочиповой анализ, метилчувствительная полимеразная цепная реакция (ПЦР), метилспецифическая амплификация зонда, зависящего от мультиплексного лигирования, а также секвенирование нового поколения (NGS). Применяемые методы по отдельности не позволяют однозначно установить наличие однородительской дисомии. Комбинация метода NGS, одновременно оценивающего статус метилирования ДНК и области потери гетерозиготности, в частности, основанного на фрагментации геномной ДНК метилзависимыми эндонуклеазами, с классическими подходами, такими, как метилчувствительная ПЦР и микросателлитное тестирование, позволит осуществлять быструю и точную диагностику однородительских дисомий.

Uniparental disomy is a type of chromosomal variation leading to in which both homologous chromosomes or chromosomal regions are inherited from one parent. Such variations have been detected for all chromosomes. The frequency of uniparental disomies is estimated at 1 case per 2000 births. The causes of uniparental disomies include errors during meiosis, postzygotic errors, Robertsonian and reciprocal translocations. Clinical manifestations are associated with loss of heterozygosity for pathogenic genetic variants and defects in genomic imprinting.Currently, the diagnosis of uniparental disomy is performed using methods such as microsatellite analysis, chromosomal microarray analysis, methyl-sensitive PCR, methyl-specific amplification of a probe dependent on multiplex ligation and next-generation sequencing (NGS). The methods used nowadays separately do not allow for a definitive diagnosis of uniparental disomy. A combination of NGS method that simultaneously assesses the DNA methylation status and regions of loss of heterozygosity, in particular those based on fragmentation of genomic DNA by methyl-dependent restriction enzymes, with classical approaches such as methyl-sensitive PCR and microsatellite testing will enable rapid and accurate diagnosis of uniparental disomies.

детиоднородительские дисомииNGS-секвенированиехромосомные перестройкиметилирование ДНКнарушения импринтингаchildrenuniparental disomiesNGSchromosomal rearrangementsDNA methylationimprinting disordersРабота выполнена при финансовой поддержке Фонда научно-технологического развития Югры в рамках научного проекта № 2023–569–05.The reported study was funded by Foundation for Scientific and Technological Development of Yugra according to the research project № 2023–569–05.ReferencesMatsubara K., Kagami M., Fukami M. Uniparental disomy as a cause of pediatric endocrine disorders. Clinical pediatric endocrinology: case reports and clinical investigations. Official journal of the Japanese Society for Pediatric Endocrinology 2018; 27(3): 113–121. DOI: 10.1297/cpe.27.113Matsubara K., Kagami M., Fukami M. Uniparental disomy as a cause of pediatric endocrine disorders. Clinical pediatric endocrinology: case reports and clinical investigations. Official journal of the Japanese Society for Pediatric Endocrinology 2018; 27(3): 113–121. DOI: 10.1297/cpe.27.113Chien S.C., Chen C.P., Liou J.D. Prenatal diagnosis and genetic counseling of uniparental disomy. Taiwan J Obstet Gynecol 2022; 61(2): 210–215. DOI: 10.1016/j.tjog.2022.02.006Chien S.C., Chen C.P., Liou J.D. Prenatal diagnosis and genetic counseling of uniparental disomy. Taiwan J Obstet Gynecol 2022; 61(2): 210–215. DOI: 10.1016/j.tjog.2022.02.006Liehr T. Uniparental disomy is a chromosomic disorder in the first place. Mol Cytogenet 2022; 15(1): 5. DOI: 10.1186/s13039–022–00585–2Liehr T. Uniparental disomy is a chromosomic disorder in the first place. Mol Cytogenet 2022; 15(1): 5. DOI: 10.1186/s13039–022–00585–2Del Gaudio D., Shinawi M., Astbury C., Tayeh M.K., Deak K. L., Rac G. et al. Diagnostic testing for uniparental disomy: a points to consider statement from the American College of Medical Genetics and Genomics (ACMG). Genetics in medicine: official journal of the American College of Medical Genetics 2020; 22(7): 1133–1141. DOI: 10.1038/s41436–020–0782–9Del Gaudio D., Shinawi M., Astbury C., Tayeh M.K., Deak K. L., Rac G. et al. Diagnostic testing for uniparental disomy: a points to consider statement from the American College of Medical Genetics and Genomics (ACMG). Genetics in medicine: official journal of the American College of Medical Genetics 2020; 22(7): 1133–1141. DOI: 10.1038/s41436–020–0782–923andMe Inc. https://www.23andme.com/ Ссылка активна на 28.02.202423andMe Inc. https://www.23andme.com/ Ссылка активна на 28.02.2024UK Biobank https://www.ukbiobank.ac.uk/ Ссылка активна на 28.02.2024UK Biobank https://www.ukbiobank.ac.uk/ Ссылка активна на 28.02.2024Nakka P., Pattillo Smith S., O’Donnell-Luria A.H., Mc-Manus K.F.; 23andMe Research Team; Mountain J.L. et al. Characterization of Prevalence and Health Consequences of Uniparental Disomy in Four Million Individuals from the General Population. Am J Hum Genet 2019; 105(5): 921–932. DOI: 10.1016/j.ajhg.2019.09.016Nakka P., Pattillo Smith S., O’Donnell-Luria A.H., Mc-Manus K.F.; 23andMe Research Team; Mountain J.L. et al. Characterization of Prevalence and Health Consequences of Uniparental Disomy in Four Million Individuals from the General Population. Am J Hum Genet 2019; 105(5): 921–932. DOI: 10.1016/j.ajhg.2019.09.016Liehr T. 2024. Cases with uniparental disomy. https://cs-tl.de/DB/CA/UPD/0-Start.html Ссылка активна на 06.02.2024Liehr T. 2024. Cases with uniparental disomy. https://cs-tl.de/DB/CA/UPD/0-Start.html Ссылка активна на 06.02.2024Benn P. Uniparental disomy: Origin, frequency, and clinical significance. Prenat Diagn 2021; 41(5): 564–572. DOI: 10.1002/pd.5837Benn P. Uniparental disomy: Origin, frequency, and clinical significance. Prenat Diagn 2021; 41(5): 564–572. DOI: 10.1002/pd.5837Баранов В.С., Кузнецова Т.В. Цитогенетика Эмбрионального развития человека: научно-практические аспекты. Однородительская дисомия. СПб: Издательство Н-Л, Учебник, 2007; 7.3: 234–266.Baranov V.S., Kuznetsova T.V. Cytogenetics of human embryonic development: scientific and practical aspects. Uniparental disomy. Saint-Petersburg: N–L Publishing House, Textbook, 2007; 7.3: 234–266. (in Russ.)Chavli E.A., Klaasen S.J., Van Opstal D., Laven J.S., Kops G.J., Baart E.B. Single-cell DNA sequencing reveals a high incidence of chromosomal abnormalities in human blastocysts. J Clin Invest 2024; 4:e174483. DOI: 10.1172/JCI174483Chavli E.A., Klaasen S.J., Van Opstal D., Laven J.S., Kops G.J., Baart E.B. Single-cell DNA sequencing reveals a high incidence of chromosomal abnormalities in human blastocysts. J Clin Invest 2024; 4:e174483. DOI: 10.1172/JCI174483Papenhausen P.R., Kelly C.A., Harris S., Caldwell S., Schwartz S., Penton A. Clinical significance and mechanisms associated with segmental UPD. Mol Cytogenet 2021; 14(1): 38. DOI: 10.1186/s13039–021–00555–0Papenhausen P.R., Kelly C.A., Harris S., Caldwell S., Schwartz S., Penton A. Clinical significance and mechanisms associated with segmental UPD. Mol Cytogenet 2021; 14(1): 38. DOI: 10.1186/s13039–021–00555–0Poot M., Hochstenbach R. Prevalence and Phenotypic Impact of Robertsonian Translocations. Mol Syndromol 2021; 12(1): 1–11. DOI: 10.1159/000512676Poot M., Hochstenbach R. Prevalence and Phenotypic Impact of Robertsonian Translocations. Mol Syndromol 2021; 12(1): 1–11. DOI: 10.1159/000512676Баранов В.С., Коган И.Ю., Кузнецова Т.В. Прогресс генетики эмбрионального развития человека и вспомогательные репродуктивные технологии. Генетика 2019; 55(10): 1109–1121.Baranov V.S., Kogan I.Yu., Kuznecova T.V. Advances in Developmental Genetics and Assisted Reproductive Technology Achievments. Genetika 2019; 55(10): 1109–1121. (in Russ.) DOI: 10.1134/S0016675819100023Демидова И.А., Ворсанова С.Г., Куринная О.С., Васин К.С., Воинова В.Ю., Зеленова М.А. и др. Молекулярное кариотипирование хромосомных аномалий и вариаций числа копий последовательностей ДНК (CNVs) при идиопатических формах умственной отсталости и эпилепсии. Научные результаты биомедицинских исследований 2020; 6(2): 172–197.Demidova I.A., Vorsanova S.G., Kurinnaya O.S., Vasin K.S., Voinova V.Y., Zelenova M.A. et al. Molecular karyotyping of chromosomal anomalies and DNA sequence copy number variations (CNVs) in idiopathic forms of mental retardation and epilepsy. Nauchnye rezul’taty biomedicinskih issledovanij 2020; 6(2): 172–197. (in Russ.) DOI: 10.18413/2658–6533–2020–6–2–0–3Liehr T. Uniparental disomy (UPD) in clinical genetics: A guide for clinicians and patients. Springer, 2014; 192.Liehr T. Uniparental disomy (UPD) in clinical genetics: A guide for clinicians and patients. Springer, 2014; 192.Коровкина Е.А, Жилина С.С., Конюхова М.Б., Немцова М.В., Карманов М.Е., Мутовин Г.Р. Синдром Сильвера–Рассела: Клинико-генетический анализ. Педиатрия. Журнал им. Г.Н. Сперанского 2011; 90(6): 41–45.Korovkina E.A., Zhilina S.S., Konyukhova M.B., Nemtsova M.V., Karmanov M.Y., Mutovin G.R. Silver–Russell syndrome: A clinical and genetic analysis. Pediatrija. Zhurnal im. G.N. Speranskogo 2011; 90(6): 41–45. (in Russ.)Хафизова Н.Р., Мерзлякова Д.Р., Сафина Ю.Ф. Синдром Сильвера–Рассела у ребенка 7 месяцев: клиническое наблюдение. РМЖ. Мать и дитя 2021; 4(1): 103–105.hafizova N.R., Merzlyakova D.R., Safina Y.F. Silver–Russel syndrome in a 7-month-old child: a clinical observation. RMZh. Mat’ i ditja 2021; 4(1): 103–105. (in Russ.)Горчханова З.К., Николаева Е.А., Боченков С.В., Белоусова Е.Д. Анализ клинических проявлений синдрома Ангельмана у детей. Российский вестник перинатологии и педиатрии 2021; 66(6): 63–70.Gorchkhanova Z.K., Nikolaeva E.A., Bochenkov S.V., Belousova E.D. Analysis of clinical manifestations of Angelman syndrome in children, Rossijskij vestnik perinatologii i pediatrii 2021; 6: 63–70. (in Russ.)Абатуров А.Е., Петренко Л.Л., Кривуша Е.Л. Синдром Ангельмана. Часть 2 (клиника и диагностика). Здоровье ребенка 2015; 6(66): 119–125.Abaturov A.E., Petrenko L.L., Krivusha E.L. Angelman syndrome. Part 2 (clinic and diagnosis). Zdorov’e rebenka 2015; 6(66): 119–125. (in Russ.)Сологиненко В.Г. Неонатология: национальное руководство. Врожденные дефекты и генетические синдромы. Под ред. Н.Н. Володина. Москва: ГЭОТАР-Медиа, 2019; 541–542.Sologinenko V.G. Neonatology: national guide. Birth defects and genetic syndromes. Еd. by N.N. Volodin. Moscow: GEOTAR-Media, 2019; 519–545. (in Russ.)Крищанович Д.Д., Артюшевская М.В., Качан С.Э., Демидович Т.В., Румянцева Н.В., Воропай Л.В. Синдром Беквита–Видемана: клинический случай, клинико-генетические маркеры. FORCIPE 2022; 5(2): 283–284.Krishchanovich D.D., Artyushevskaya M.V., Kachan S.E., Demidovich T.V., Rumyanceva N.V., Voropaj L.V. Beckwith–Wiedemann syndrome: clinical case, clinical and genetic markers. FORCIPE. 2022; 5(2): 283–284. (in Russ.)Семенова Н.А., Анисимова И.В., Володин И.В., Ступина А.В., Абдраисова А.Т., Цокова И.Б. и др. Делеция импринтированного региона 14q32.2 у пациента с синдромом Кагами–Огата. Медицинская генетика 2018; 17(11): 43–47.Semenova N.A., Anisimova I.V., Volodin I.V., Stupina A.V., Abdraisova A.T., Tsokova I.B. et al. Deletion of imprinted region 14q32.2 in a patient with Kagami–Ogata syndrome. Medicinskaja genetika 2018; 17(11): 43–47. (in Russ.) DOI: 10.25557/2073–7998.2018.11.43–47Хурс О.М., Политыко А.Д., Румянцева Н.В., Исакович Л.В., Кулак В.Д., Квасникова Н.В. и др. Синдром Прадера–Вилли в Беларуси: генетическая структура и фенотипическая характеристика. Весці Нацыянальнай акадэміі навук Беларусі. Серыя медыцынскіх навук 2010; 1: 5–10.Hurs O.M., Polityko A.D., Rumyanceva N.V., Isakovich L.V., Kulak V.D., Kvasnikova N.V. Prader–Willi syndrome in Belarus: genetic structure and phenotypic characteristics. Vescі Nacyjanal’naj akadjemіі navuk Belarusі. Seryja medycynskіh navuk 2010; 1: 5–10. (in Russ.)Вашукова Е.С., Тарасенко О.А., Козюлина П.Ю., Моршнева А.В., Мальцева А.Р., Глотов А.С. Оценка эффективности полногеномного неинвазивного пренатального тестирования для выявления редких хромосомных аномалий на основе опыта ФГБНУ «НИИ АГиР им. Д.О. Отта». Медицинская генетика 2022; 21(11): 19–22.Vashukova E.S., Tarasenko O.A., Kozyulina P.Yu., Morshneva A.V., Maltseva A.R., Glotov A.S. Evaluation of the whole-genome non-invasive prenatal testing effectiveness for detection of rare chromosomal abnormalities based on the Research Institute of Obstetrics, Gynecology and Reproductology named after D.O. Ott experience. Medicinskaja genetika 2022; 21(11): 19–22. (in Russ.) DOI: 10.25557/2073–7998.2022.11.19–22Zhang K., Liu S., Feng B., Yang Y., Zhang H., Dong R. et al.Clinical Application of an Innovative Multiplex-Fluorescent-Labeled STRs Assay for Prader-Willi Syndrome and Angelman Syndrome. PLoS One 2016; 11(2): e0147824. DOI: 10.1371/journal.pone.0147824Eggermann K., Bliek J., Brioude F., Algar E., Buiting K., Russo S., et al. EMQN best practice guidelines for the molecular genetic testing and reporting of chromosome 11p15 imprinting disorders: Silver–Russell and Beckwith–Wiedemann syndrome. Eur J Hum Genet 2016; 24: 1377–1387. DOI 10.1038/ejhg.2016.45Eggermann K., Bliek J., Brioude F., Algar E., Buiting K., Russo S., et al. EMQN best practice guidelines for the molecular genetic testing and reporting of chromosome 11p15 imprinting disorders: Silver–Russell and Beckwith–Wiedemann syndrome. Eur J Hum Genet 2016; 24: 1377–1387. DOI 10.1038/ejhg.2016.45Su H., Sun T., Chen M., Liu J., Wang X., Chen Y., et al. Multiple methods used for type detection of uniparental disomy in paternity testing. Int J Legal Med 2020; 134(3): 885–893. DOI: 10.1007/s00414–019–02215-wSu H., Sun T., Chen M., Liu J., Wang X., Chen Y., et al. Multiple methods used for type detection of uniparental disomy in paternity testing. Int J Legal Med 2020; 134(3): 885–893. DOI: 10.1007/s00414–019–02215-wЧернов А.Н., Глотов О.С., Донников М.Ю., Коваленко Л.В., Белоцерковцева Л.Д., Глотов А.С. Пренатальная генетическая диагностика: принципы, методы, применение и перспективы. Вестник СурГУ. Медицина 2020; 2(44): 54–65.Chernov A.N., Glotov O.S., Donnikov M.Yu., Kovalenko L.V., Belocerkovceva L.D., Glotov A.S. Prenatal genetic diagnosis: principles, methods, applications and prospects. Vestnik SurGU. Medicina 2020; 2(44): 54–65. (in Russ.)Hoppman N., Rumilla K., Lauer E., Kearney H., Thorland E. Patterns of homozygosity in patients with uniparental disomy: detection rate and suggested reporting thresholds for SNP microarrays. Genet Med 2018; 20(12): 1522–1527. DOI: 10.1038/gim.2018.24Hoppman N., Rumilla K., Lauer E., Kearney H., Thorland E. Patterns of homozygosity in patients with uniparental disomy: detection rate and suggested reporting thresholds for SNP microarrays. Genet Med 2018; 20(12): 1522–1527. DOI: 10.1038/gim.2018.24Sahoo T., Dzidic N., Strecker M.N., Commander S., Travis M.K., Doherty C. et al. Comprehensive genetic analysis of pregnancy loss by chromosomal microarrays: outcomes, benefits, and challenges. Genet Med 2017; 19(1): 83–89. DOI: 10.1038/gim.2016.69Sahoo T., Dzidic N., Strecker M.N., Commander S., Travis M.K., Doherty C. et al. Comprehensive genetic analysis of pregnancy loss by chromosomal microarrays: outcomes, benefits, and challenges. Genet Med 2017; 19(1): 83–89. DOI: 10.1038/gim.2016.69Xu C., Li M., Gu T., Xie F., Zhang Y., Wang D., et al. Chromosomal microarray analysis for prenatal diagnosis of uniparental disomy: a retrospective study. Mol Cytogenet 2024; 17(1): 3. DOI: 10.1186/s13039–023–00668–8Xu C., Li M., Gu T., Xie F., Zhang Y., Wang D., et al. Chromosomal microarray analysis for prenatal diagnosis of uniparental disomy: a retrospective study. Mol Cytogenet 2024; 17(1): 3. DOI: 10.1186/s13039–023–00668–8Лебедев И.Н., Шилова Н.В., Юров И.Ю., Малышева О.В., Твеленева А.А., Миньженкова М.Е. и др. Рекомендации Российского общества медицинских генетиков по хромосомному микроматричному анализу. Медицинская генетика 2023; 22(10): 3–47.Lebedev I.N., Shilova N.V., Iourov I.Yu., Malysheva O.V., Tveleneva A.A., Minzhenkova M.E. et al. Guidelines of the Russian Society of Medical Geneticists for Chromosomal Microarray Analysis. Medicinskaya genetika 2023; 22(10): 3–47. (in Russ.)Саженова Е.А., Лебедев И.Н. Стандарты молекулярно-генетической ДНК-диагностики болезней геномного импринтинга на примере синдромов Прадера–Вилли и Энгельмана. Медицинская генетика 2015; 14(9): 3–10.Sazhenova E.A., Lebedev I.N. Standards of molecular genetic DNA diagnostics of genomic imprinting diseases on the example of Prader–Willi and Engelman syndromes. Medicinskaya genetika 2015; 14(9): 3–10. (in Russ.)Hong D.K., Park J.E., Kang K.M., Shim S.H., Shim S.H., Han Y.J. et al. Prenatal Diagnosis of Uniparental Disomy in Cases of Rare Autosomal Trisomies Detected Using Noninvasive Prenatal Test: A Case of Prader–Willi Syndrome. Diagnostics (Basel) 2023; 13(4): 580. DOI: 10.3390/diagnostics13040580Hong D.K., Park J.E., Kang K.M., Shim S.H., Shim S.H., Han Y.J. et al. Prenatal Diagnosis of Uniparental Disomy in Cases of Rare Autosomal Trisomies Detected Using Noninvasive Prenatal Test: A Case of Prader–Willi Syndrome. Diagnostics (Basel) 2023; 13(4): 580. DOI: 10.3390/diagnostics13040580Брызгунова О.Е., Лактионов П.П. Современные методы исследования метилирования внеклеточных ДНК. Молекулярная биология 2017; 51(2): 195–214.Bryzgunova O.E., Laktionov P.P. Current methods of extracellular DNA methylation analysis. Molekuljarnaja biologija 2017; 51(2): 195–214. (in Russ). DOI: 10.7868/S0026898417010074Dos Santos J.F., Mota L.R., Rocha P.H., Ferreira de Lima R.L. A modified MS-PCR approach to diagnose patients with Prader-Willi and Angelman syndrome. Mol Biol Rep 2016; 43(11): 1221–1225. DOI: 10.1007/s11033–016–4055–2Dos Santos J.F., Mota L.R., Rocha P.H., Ferreira de Lima R.L. A modified MS-PCR approach to diagnose patients with Prader-Willi and Angelman syndrome. Mol Biol Rep 2016; 43(11): 1221–1225. DOI: 10.1007/s11033–016–4055–2Kim B., Park Y., Cho S.I., Kim M.J., Chae J.H., Kim J.Y. et al. Clinical Utility of Methylation-Specific Multiplex Ligation-Dependent Probe Amplification for the Diagnosis of Prader–Willi Syndrome and Angelman Syndrome. Ann Lab Med 2022;42(1): 79–88. DOI: 10.3343/alm.2022.42.1.79.Kim B., Park Y., Cho S.I., Kim M.J., Chae J.H., Kim J.Y. et al. Clinical Utility of Methylation-Specific Multiplex Ligation-Dependent Probe Amplification for the Diagnosis of Prader–Willi Syndrome and Angelman Syndrome. Ann Lab Med 2022;42(1): 79–88. DOI: 10.3343/alm.2022.42.1.79.Ribeiro Ferreira I., Darleans Dos Santos Cunha W., Henrique Ferreira Gomes L., Azevedo Cintra H., Lopes Cabral Guimarães Fonseca L., Ferreira Bastos E. et al. A rapid and accurate methylation-sensitive high-resolution melting analysis assay for the diagnosis of Prader Willi and Angelman patients. Mol Genet Genomic Med 2019; 7(6): e637. DOI: 10.1002/mgg3.637Ribeiro Ferreira I., Darleans Dos Santos Cunha W., Henrique Ferreira Gomes L., Azevedo Cintra H., Lopes Cabral Guimarães Fonseca L., Ferreira Bastos E. et al. A rapid and accurate methylation-sensitive high-resolution melting analysis assay for the diagnosis of Prader Willi and Angelman patients. Mol Genet Genomic Med 2019; 7(6): e637. DOI: 10.1002/mgg3.637Meyer R., Begemann M., Hübner C.T., Dey D., Kuechler A., Elgizouli M. One test for all: whole exome sequencing significantly improves the diagnostic yield in growth retarded patients referred for molecular testing for Silver–Russell syndrome. Orphanet J Rare Dis 2021; 16(1): 42. DOI: 10.1186/s13023–021–01683-xMeyer R., Begemann M., Hübner C.T., Dey D., Kuechler A., Elgizouli M. One test for all: whole exome sequencing significantly improves the diagnostic yield in growth retarded patients referred for molecular testing for Silver–Russell syndrome. Orphanet J Rare Dis 2021; 16(1): 42. DOI: 10.1186/s13023–021–01683-xXiao B., Wang L., Liu H., Fan Y., Xu Y., Sun Y. et al. Uniparental isodisomy caused autosomal recessive diseases: NGSbased analysis allows the concurrent detection of homogenous variants and copy-neutral loss of heterozygosity. Mol Genet Genomic Med 2019; 7(10): e00945. DOI: 10.1002/mgg3.945Xiao B., Wang L., Liu H., Fan Y., Xu Y., Sun Y. et al. Uniparental isodisomy caused autosomal recessive diseases: NGSbased analysis allows the concurrent detection of homogenous variants and copy-neutral loss of heterozygosity. Mol Genet Genomic Med 2019; 7(10): e00945. DOI: 10.1002/mgg3.945Scuffins J., Keller-Ramey J., Dyer L., Douglas G., Torene R., Gainullin V., et al. Uniparental disomy in a population of 32,067 clinical exome trios. Genet Med 2021; 23(6): 1101–1107. DOI: 10.1038/s41436–020–01092–8Scuffins J., Keller-Ramey J., Dyer L., Douglas G., Torene R., Gainullin V., et al. Uniparental disomy in a population of 32,067 clinical exome trios. Genet Med 2021; 23(6): 1101–1107. DOI: 10.1038/s41436–020–01092–8Bis D.M., Schüle R., Reichbauer J., Synofzik M., Rattay T.W., Soehn A. et al. Uniparental disomy determined by whole-exome sequencing in a spectrum of rare motoneuron diseases and ataxias. Mol Genet Genomic Med 2017; 5: 280–286. DOI: 10.1002/mgg3.285Bis D.M., Schüle R., Reichbauer J., Synofzik M., Rattay T.W., Soehn A. et al. Uniparental disomy determined by whole-exome sequencing in a spectrum of rare motoneuron diseases and ataxias. Mol Genet Genomic Med 2017; 5: 280–286. DOI: 10.1002/mgg3.285Wang L., Liu P., Bi W., Sim T., Wang X., Walkiewicz M. et al. Contribution of uniparental disomy in a clinical trio exome cohort of 2675 patients. Mol Genet Genomic Med 2021; 9(11): e1792. DOI: 10.1002/mgg3.1792Wang L., Liu P., Bi W., Sim T., Wang X., Walkiewicz M. et al. Contribution of uniparental disomy in a clinical trio exome cohort of 2675 patients. Mol Genet Genomic Med 2021; 9(11): e1792. DOI: 10.1002/mgg3.1792Song J., Shao H. SNP Array in Hematopoietic Neoplasms: A Review. Microarrays (Basel) 2015; 5(1): 1. DOI: 10.3390/microarrays5010001Song J., Shao H. SNP Array in Hematopoietic Neoplasms: A Review. Microarrays (Basel) 2015; 5(1): 1. DOI: 10.3390/microarrays5010001Eggermann T., Mackay D.J.G., Tömer Z. Uniparental Disomy and Imprinting Disorders. OBM Genetics 2018; 2(3): 031. DOI: 10.21926/obm.genet.1803031Eggermann T., Mackay D.J.G., Tömer Z. Uniparental Disomy and Imprinting Disorders. OBM Genetics 2018; 2(3): 031. DOI: 10.21926/obm.genet.1803031Yauy K., de Leeuw N., Yntema H.G., Pfundt R., Gilissen C. Accurate detection of clinically relevant uniparental disomy from exome sequencing data. Genet Med 2020; 22(4): 803–808. DOI: 10.1038/s41436–019–0704-xYauy K., de Leeuw N., Yntema H.G., Pfundt R., Gilissen C. Accurate detection of clinically relevant uniparental disomy from exome sequencing data. Genet Med 2020; 22(4): 803–808. DOI: 10.1038/s41436–019–0704-xRadtke M., Moch J., Hentschel J., Schumann I. altAFplotter: a web app for reliable UPD detection in NGS diagnostics. bioRxiv 2023.08.08.546838. DOI: 10.1101/2023.08.08.546838Radtke M., Moch J., Hentschel J., Schumann I. altAFplotter: a web app for reliable UPD detection in NGS diagnostics. bioRxiv 2023.08.08.546838. DOI: 10.1101/2023.08.08.546838Gouil Q., Keniry A. Latest techniques to study DNA methylation. Essays Biochem 2019; 63(6): 639–648. DOI: 10.1042/EBC20190027Gouil Q., Keniry A. Latest techniques to study DNA methylation. Essays Biochem 2019; 63(6): 639–648. DOI: 10.1042/EBC20190027Ishida M. New developments in Silver–Russell syndrome and implications for clinical practice. Epigenomics 2016; 8(4): 563–580. DOI: 10.2217/epi-2015–0010Ishida M. New developments in Silver–Russell syndrome and implications for clinical practice. Epigenomics 2016; 8(4): 563–580. DOI: 10.2217/epi-2015–0010Yong W.S., Hsu F.M., Chen P.Y. Profiling genome-wide DNA methylation. Epigenetics Chromatin 2016; 9: 26. DOI: 10.1186/s13072–016–0075–3Yong W.S., Hsu F.M., Chen P.Y. Profiling genome-wide DNA methylation. Epigenetics Chromatin 2016; 9: 26. DOI: 10.1186/s13072–016–0075–3Yamada M., Okuno H., Okamoto N., Suzuki H., Miya F., Takenouchi T. et al. Diagnosis of Prader–Willi syndrome and Angelman syndrome by targeted nanopore long-read sequencing. Eur J Med Genet 2023; 66(2): 104690. DOI: 10.1016/j.ejmg.2022.104690Yamada M., Okuno H., Okamoto N., Suzuki H., Miya F., Takenouchi T. et al. Diagnosis of Prader–Willi syndrome and Angelman syndrome by targeted nanopore long-read sequencing. Eur J Med Genet 2023; 66(2): 104690. DOI: 10.1016/j.ejmg.2022.104690Aberg K.A., Chan R.F., van den Oord E.J.C.G. MBD-seq — realities of a misunderstood method for high-quality methylome-wide association studies. Epigenetics 2020; 15(4): 431–438. DOI: 10.1080/15592294.2019.1695339Aberg K.A., Chan R.F., van den Oord E.J.C.G. MBD-seq — realities of a misunderstood method for high-quality methylome-wide association studies. Epigenetics 2020; 15(4): 431–438. DOI: 10.1080/15592294.2019.1695339Xing X., Zhang B., Li D., Wang T. Comprehensive Whole DNA Methylome Analysis by Integrating MeDIP-seq and MRE-seq. Methods Mol Biol 2018; 1708: 209–246. DOI: 10.1007/978–1–4939–7481–8_12Xing X., Zhang B., Li D., Wang T. Comprehensive Whole DNA Methylome Analysis by Integrating MeDIP-seq and MRE-seq. Methods Mol Biol 2018; 1708: 209–246. DOI: 10.1007/978–1–4939–7481–8_12Abdurashitov M.A., Tomilov V.N., Gonchar D.A., Kuznetsov V.V., Degtyarev S.K. Mapping of R(5mC)GY Sites in the Genome of Human Malignant Cell Line Raji. Biol Med (Aligarh) 2015; 7(4): BM-135–15, 6 pages.Abdurashitov M.A., Tomilov V.N., Gonchar D.A., Kuznetsov V.V., Degtyarev S.K. Mapping of R(5mC)GY Sites in the Genome of Human Malignant Cell Line Raji. Biol Med (Aligarh) 2015; 7(4): BM-135–15, 6 pages.Boers R., Boers J., de Hoon B., Kockx C., Ozgur Z., Molijn A. et al. Genome-wide DNA methylation profiling using the methylation-dependent restriction enzyme LpnPI. Genome Res 2018; 28(1): 88–99. DOI: 10.1101/gr.222885.117Boers R., Boers J., de Hoon B., Kockx C., Ozgur Z., Molijn A. et al. Genome-wide DNA methylation profiling using the methylation-dependent restriction enzyme LpnPI. Genome Res 2018; 28(1): 88–99. DOI: 10.1101/gr.222885.117Abdurashitov M.A., Tomilov V.N., Gonchar D.A., Snezhkina A.V., Krasnov G.S., Kudryavtseva A.V. et al. Comparative Analysis Of RCGY Sites Methylation In Three Human Cell Lines. Epigenetic DNA diagnostics 2019; 1. DOI: 26213/SE.2019.76.40116Abdurashitov M.A., Tomilov V.N., Gonchar D.A., Snezhkina A.V., Krasnov G.S., Kudryavtseva A.V. et al. Comparative Analysis Of RCGY Sites Methylation In Three Human Cell Lines. Epigenetic DNA diagnostics 2019; 1. DOI: 26213/SE.2019.76.40116

The authors declare that there are no conflicts of interest present.