

Анализ РНК как перспективное направление диагностики в нефрологии
https://doi.org/10.21508/1027-4065-2023-68-4-24-XX
Аннотация
В настоящее время традиционные диагностические инструменты не отвечают современным запросам. Методы молекулярной диагностики не только дополняют традиционные методы исследования, но и дают понимание с точки зрения молекулярной патофизиологии. Анализ матричной РНК — новая область, которая может произвести революцию в диагностике и лечении заболеваний почек. Изучение мРНК может быть применимо для диагностики и классифицирования заболеваний почек, прогнозирования прогрессирования нефропатий, контроля эффективности лечения и разработки современных подходов к терапии. Будучи новой областью, анализ мРНК сталкивается с рядом проблем и ограничений, однако с развитием технологий методика становится более доступной для применения в клинической практике.
Об авторах
С. Л. МорозовРоссия
Сергей Леонидович Морозов, к. м. н., вед. науч. сотр.
отдел наследственных и приобретенных болезней почек им. проф. М. С. Игнатовой
125412
ул. Талдомская, д. 2
Москва
В. П. Пахомова
Россия
Виктория Павловна Пахомова, лаборант-исследователь
лаборатория клинической геномики и биоинформатики
125412
ул. Талдомская, д. 2
Москва
В. Ю. Воинова
Россия
Виктория Юрьевна Воинова, д. м. н., зам. дир. по трансляционной медицине, гл. науч. сотр.
отдел клинической генетики
125412
ул. Талдомская, д. 2
Москва
В. В. Длин
Россия
Владимир Викторович Длин, д. м. н., проф., рук. отдела, зам. дир. по научной работе в педиатрии
отдел наследственных и приобретенных болезней почек им. проф. М. С. Игнатовой
125412
ул. Талдомская, д. 2
Москва
Список литературы
1. Морозов С.Л., Длин В.В., Сухоруков В.С., Воронкова А.С. Молекулярная нефропатология: новые возможности диагностики заболеваний почек. Российский вестник перинатологии и педиатрии 2017; 62(3): 32–36. DOI: 10.21508/1027–4065–2017–62–3–32–36
2. Морозов С.Л., Воронкова А.С., Длин В.В., Туркина Т.И., Сухоруков В.С. Анализ экспрессии генов по технологии nCounter Nanostring в медицинских исследованиях: опыт использования у детей с нефротическим синдромом. Российский вестник перинатологии и педиатрии 2019; 64(1): 110–115. DOI: 10.21508/1027–4065–2019–64–1–110–115
3. Neuen B.L., Bello A.K., Levin A., Lunney M., Osman M.A., Ye F. et al. National health policies and strategies for addressing chronic kidney disease: Data from the International Society of Nephrology Global Kidney Health Atlas. PLOS Glob Public Health 2023; 3(2): e0001467. DOI: 10.1371/journal.pgph.0001467
4. Морозов С.Л., Аксенова М.Е. Первичный нефротический синдром у детей. Перспективы персонализированной терапии. Практическая Медицина 2018; (8): 39–42.
5. Игнатова М.С., Длин В.В. Нефротический синдром: прошлое, настоящее и будущее. Российский вестник перинатологии и педиатрии 2017; 62(6): 29–44. URL: https://cyberleninka.ru/article/n/nefroticheskiy-sindrom-proshloe-nastoyaschee-i-buduschee?ysclid=lm7k8pcbn0915911031
6. Liu K-Z., Tian G., Ko AC-T., Geissler M., Brassard D., Veres T. Detection of renal biomarkers in chronic kidney disease using microfluidics: progress, challenges and opportunities. Biomed Microdevices 2020; 22(2): 29. DOI: 10.1007/s10544–020–00484–6
7. Длин В.В., Морозов С.Л. Персонализированная терапия в детской нефрологии: проблемы и перспективы. Российский вестник перинатологии и педиатрии 2021; 66(2): 6–12. DOI: 10.21508/1027–4065–2021–66–2–6–12
8. Игнатова М.С., Морозов С.Л., Крыганова Т.А., Шенцева Д.В., Назарова Н.Ф., Конькова Н.Е. и др. Современные представления о врожденных аномалиях органов мочевой системы (синдром CAKUT) у детей. Клиническая нефрология 2013; 2: 58–64.
9. Mizdrak M., Kumrić M., Kurir T.T, Božić J. Emerging biomarkers for early detection of chronic kidney disease. JPM 2022; 12(4): 548. DOI: 10.3390/jpm12040548
10. Reidy K., Kang H.M., Hostetter T., Susztak K. Molecular mechanisms of diabetic kidney disease. J Clin Invest 2014; 124(6): 2333–2340. DOI: 10.1172/JCI72271.
11. Yan Z., Wang G., Shi X. Advances in the progression and prognosis Biomarkers of chronic kidney disease. Front Pharmacol 2021; 12: 785375. DOI: 10.3389/fphar.2021.785375
12. Длин В.В., Морозов С.Л. Нефротический синдром: возможна ли персонализированная терапия? Обзор. Педиатрия. Восточная Европа 2023; 11(1): 65–76. DOI: 10.34883/PI.2023.11.1.007
13. Морозов С.Л., Коваль Н.Ю., Столяревич Е.С., Пирузиева О.Р., Лепаева Т.В., Никишина Т.А. и др. Волчаночный нефрит как актуальная проблема педиатрической нефрологии. Клинический пример люпус нефрита I класса у ребенка с нефротическим синдромом. Практическая Медицина 2022; 20(2): 13–19.
14. Varnell C.D., Stone H.K., Welge J.A. Bleeding complications after pediatric kidney biopsy: A Systematic Review and Meta-Analysis. CJASN. 2019; 14(1): 57–65. DOI: 10.2215/CJN.05890518
15. Floege J., Mak R.H., Molitoris B.A., Remuzzi G., Ronco P. Nephrology research — the past, present and future. Nat Rev Nephrol 2015; 11(11): 677–687. DOI: 10.1038/nrneph.2015.152
16. Molecular biology of the cell. 5<sup>th</sup> ed. Editor: B. Alberts New York: Garland Science; 2008: 1392.
17. Crick F.H. The genetic code--yesterday, today, and tomorrow. Cold Spring Harb Symp Quant Biol 1966; 31: 1–9.
18. Moore M.J., Proudfoot N.J. Pre-mRNA processing reaches back to transcription and ahead to translation. Cell 2009; 136(4): 688–700. DOI: 10.1016/j.cell.2009.02.001
19. Van De Vrie M., Deegens J.K., Eikmans M., Van Der Vlag J., Hilbrands L.B. Urinary MicroRNA as Biomarker in Renal Transplantation. Am J Transplant 2017; 17(5): 1160–1166. DOI: 10.1111/ajt.14082
20. Li B., Hartono C., Ding R., Sharma V.K., Ramaswamy R., Qian B. et al. Noninvasive diagnosis of renal-allograft rejection by measurement of messenger RNA for perforin and granzyme B in urine. N Engl J Med 2001; 344(13): 947–954. DOI: 10.1056/NEJM200103293441301
21. Mas V.R., Dumur C.I., Scian M.J., Gehrau R.C., Maluf D.G. MicroRNAs as biomarkers in solid organ transplantation. Am J Transplant 2013; 13(1): 11–19. DOI: 10.1111/j.1600–6143.2012.04313.x
22. ilflingseder J., Reindl-Schwaighofer R., Sunzenauer J., Kainz A., Heinzel A., Mayer B. et al. MicroRNAs in kidney transplantation. Nephrol Dial Transplant 2015; 30(6): 910–917. DOI: 10.1093/ndt/gfu280
23. Zhang W., Yi Z., Keung K.L., Shang H., Wei C., Cravedi P. et al. A peripheral blood gene expression signature to diagnose subclinical acute rejection. JASN [Internet] 2019; 30(8): 1481–1494. DOI: 10.1681/ASN.2018111098
24. Woroniecka K.I., Park A.S.D., Mohtat D., Thomas D.B., Pullman J.M., Susztak K. Transcriptome analysis of human diabetic kidney disease. Diabetes 2011; 60(9): 2354–2369. DOI: 10.2337/db10–1181
25. Kalantari S., Nafar M. A comprehensive narrative review of diagnostic biomarkers in human primary membranous nephropathy. Biomark Med 2017; 11(9): 781–797. DOI: 10.2217/bmm-2017–0081
26. Морозов С.Л. Особенности экспрессии генов иммунной системы при стероидрезистентном нефротическом синдроме. Российский вестник перинатологии и педиатрии 2018; 63(4): 221–222. DOI: 10.21508/1027–4065-congress-2018
27. Youssef D.M., Elbehidy R.M., Abdelhalim H.S., Amr G.E. Soluble interleukine-2 receptor and MDR1 gene expression levels as inflammatory biomarkers for prediction of steroid response in children with nephrotic syndrome. Iran J Kidney Dis 2011; 5(3): 154–161.
28. Морозов С.Л., Воронкова А.С., Длин В.В. Значение экспрессии гена ABCB1 у детей с идиопатическим нефротическим синдромом. Нефрология 2021; 25(1): 83–89. DOI: 10.36485/1561–6274–2021–25–1–83–89
29. Donn R., Berry A., Stevens A., Farrow S., Betts J., Stevens R. et al. Use of gene expression profiling to identify a novel glucocorticoid sensitivity determining gene, BMPRII. FASEB J 2007; 21(2): 402–414. DOI: 10.1096/fj.06–7236com
30. Eikmans M., Baelde H.J., De Heer E., Bruijn J.A. Messenger RNA assessment in clinical nephrology: perspectives and progress of methodology. Nephrol Dialys Transplant 2005; 20(12): 2598–2601. DOI: 10.1093/ndt/gfi176
31. Shao О., Yang H., Zhuang X., Liao J., Yang P., Cheng J. et al. scDeepSort: a pre-trained cell-type annotation method for single-cell transcriptomics using deep learning with a weighted graph neural network. Nucleic Acids Res 2021; 49(21): e122–e122. DOI: 10.1093/nar/gkab775
32. Камышова Е.С., Бобкова И.Н., Кутырина И.М. Современные представления о роли микрорнк при диабетической нефропатии: потенциальные биомаркеры и мишени таргетной терапии. Сахарный диабет 2017; 20(1): 42–50. DOI: 10.14341/DM8237
33. Mengel M., Loupy A., Haas M., Roufosse C., Naesens M., Akalin E. et al. Banff 2019 Meeting Report: Molecular diagnostics in solid organ transplantation–Consensus for the Banff Human Organ Transplant (B-HOT) gene panel and open source multicenter validation. Am J Transplant 2020; 20(9): 2305–2317. DOI: 10.1111/ajt.16059
Рецензия
Для цитирования:
Морозов С.Л., Пахомова В.П., Воинова В.Ю., Длин В.В. Анализ РНК как перспективное направление диагностики в нефрологии. Российский вестник перинатологии и педиатрии. 2023;68(4):24-31. https://doi.org/10.21508/1027-4065-2023-68-4-24-XX
For citation:
Morozov S.L., Pakhomova V.P., Voinova V.Yu., Dlin V.V. RNA analysis as a promising area of diagnostics in nephrology. Rossiyskiy Vestnik Perinatologii i Pediatrii (Russian Bulletin of Perinatology and Pediatrics). 2023;68(4):24-31. (In Russ.) https://doi.org/10.21508/1027-4065-2023-68-4-24-XX