Кишечная микробиота при хронических заболеваниях печени у детей

Влияние кишечной микробиоты на развитие различных заболеваний вызывает огромный интерес исследователей. Однако данные об аксономическом разнообразии кишечной микробиоты при хронических заболеваниях печени у детей отсутствуют. Цель исследования. Изучение таксономического разнообразия кишечной микробиоты у детей с хроническими заболеваниями печени в сравнении с здоровыми пациентами.

Материалы и методы. Проведен метагеномный анализ кишечной микробиоты 24 детей с хроническими заболеваниями печени (средний возраст 10,3±4,7 года) с выделением целевого фрагмента гена 16S рРНК. В основную группу вошли 18 детей с аутоиммунными заболеваниями печени и 6 детей с неаутоиммунными заболеваниями печени. Группу сравнения составили 34 условно здоровых ребенка.

Результаты. Исследование выявило 684 вида микроорганизмов в исследуемых образцах кала пациентов. Анализ исследований показал, что образцы кала здоровых детей и пациентов с хроническими заболеваниями печени различаются по бактериальному разнообразию. Доминирующим таксоном у здоровых детей были Neisseria flavescens, у пациентов с хроническими заболеваниями печени — Bifidobacterium longum, Bifidobacterium adolescentis, Blautia massiliensis. При этом Bifidobacterium longum, Bifidobacterium adolescentis, Blautia massiliensis в образцах кала пациентов с хроническими заболеваниями печени повышено в 8 раз.

Заключение. Выявлены показатели различия в составе кишечной микробиоты у здоровых детей и детей с хроническими заболеваниями печени.

1. Xu X.R., Liu C.Q., Feng B.S., Liu Z.J. Dysregulation of mucosal immune response in pathogenesis of inflammatory bowel disease. World J Gastroenterol 2014; 20(12): 3255–3264. DOI: 10.3748/wjg.v20.i12.3255

2. Carrière J., Darfeuille-Michaud A., Nguyen H.T. Infectious etiopathogenesis of Crohn’s disease. World J Gastroenterol 2014; 20(34): 12102–12117. DOI: 10.3748/wjg.v20.i34.12102

3. Abraham C., Cho J.H. Inflammatory bowel disease. N Engl J Med 2009; 361(21): 2066–2078. DOI: 10.1056/NEJMra0804647

4. Kaser A., Zeissig S., Blumberg R.S. Inflammatory bowel disease. Annu Rev Immunol 2010; 28: 573–621. DOI: 10.1146/annurev-immunol-030409–101225

5. David L.A., Maurice C.F., Carmody R.N., Gootenberg D.B., Button J.E., Wolfe B.E. et al. Diet rapidly and reproducibly alters the human gut microbiome. Nature 2014; 505(7484): 559–563. DOI: 10.1038/nature12820

6. Sonnenburg E.D., Smits S.A., Tikhonov M., Higginbottom S.K., Wingreen N.S., Sonnenburg J.L. Diet-induced extinctions in the gut microbiota compound over generations. Nature 2016; 529(7585): 212–215. DOI: 10.1038/nature16504

7. Modi S.R., Collins J.J., Relman D.A. Antibiotics and the gut microbiota. Clin Invest 2014; 124(10): 4212–4218. DOI: 10.1172/JCI72333

8. Maurice C.F., Haiser H.J., Turnbaugh P.J. Xenobiotics shape the physiology and gene expression of the active human gut microbiome. Cell 2013; 152(1–2): 39–50. DOI: 10.1016/j.cell.2012.10.052

9. Sonnenburg J.L., Backhed F. Diet-microbiota interactions as moderators of human metabolism. Nature 2016; 535(7610): 56–64. DOI: 10.1038/nature18846

10. Huttenhower C., Gevers D., Knight R., Abubucker S., Badger J.H., Chinwalla A.T. et al. Human Microbiome Project Consortium. Structure, function and diversity of the healthy human microbiome. Nature 2012; 486(7402): 207–214. DOI: 10.1038/nature11234

11. Gevers D., Kugathasan S., Denson L.A., Vázquez-Baeza Y., Van Treuren W., Ren B. et al. The treatment-naive microbiome in new-onset Crohn’s disease. Cell Host Microbe 2014; 15(3): 382–392. DOI: 10.1016/j.chom.2014.02.005

12. Kummen M., Hov J.R. The gut microbial influence on cholestatic liver disease. Liver Int 2019; 39(7): 1186–1196. DOI: 10.1111/liv.14153

13. Nakamoto N., Sasaki N., Aoki R., Miyamoto K., Suda W., Teratani T. et al. Gut pathobionts underlie intestinal barrier dysfunction and liver T helper 17 cell immune response in primary sclerosing cholangitis. Nat Microbiol 2019; 4(3): 492– 503. DOI: 10.1038/s41564–018–0333–1

14. Liao L., Schneider K.M., Galvez E.J.C., Frissen M., Marschall H.U., Su H. et al. Intestinal dysbiosis augments liver disease progression via NLRP3 in a murine model of primary sclerosing cholangitis. Gut 2019; 68(8): 1477–1492. DOI: 10.1136/gutjnl-2018–316670

15. Волынец Г.В., Никитин А.В., Скворцова Т.А. Кишечный микробном и современные методы его исследования у детей. Российский вестник перинатологии и педиатрии 2022: 67 (4): 5–13. DOI: 10.21508/1027–4065–2022–67–4–5–13