Preview

Российский вестник перинатологии и педиатрии

Расширенный поиск

Анализ экспрессии генов по технологии nCounter Nanostring в медицинских исследованиях: опыт использования у детей с нефротическим синдромом

https://doi.org/10.21508/1027-4065-2019-64-1-110-115

Полный текст:

Аннотация

В эпоху современной медицины сформировались фундаментальные научные установки в диагностике  широкого круга заболеваний, которые основаны на традиционных инструментах: лабораторных и функциональных исследованиях,  световой микроскопии, иммунофлюоресценции и электронной микроскопии. Однако в последние десятилетия эти методы становятся недостаточными для верификации различных вариантов течения заболеваний, особенно с нетипичной клинической картиной. В статье рассматриваются возможности новой технологии nCounter от компании «Nanostring Technologies»,  подробно описаны возможности технологии в диагностике различных заболеваний, а также приведен собственный опыт использования в диагностике у детей с нефротическим синдромом.

Об авторах

С. Л. Морозов
Научно-исследовательский клинический институт педиатрии им. академика Ю.Е. Вельтищева
Россия

Морозов   Сергей  Леонидович – кандидат медицинских наук,   старший научный сотрудник отдела наследственных и приобретенных болезней  почек.

125412 Москва,  ул Талдомская, д.2.



А. С. Воронкова
Научно-исследовательский клинический институт педиатрии им. академика Ю.Е. Вельтищева
Россия

Воронкова  Анастасия  Сергеевна  – научный сотрудник  лаборатории общей  патологии.

125412 Москва,  ул Талдомская, д.2.



В. В. Длин
Научно-исследовательский клинический институт педиатрии им. академика Ю.Е. Вельтищева
Россия

Длин Владимир Викторович – доктор медицинских наук, профессор, заведующий отделом наследственных и приобретенных болезней  почек.

125412 Москва,  ул Талдомская, д.2.



Т. И. Туркина
РНИМУ им. Н.И. Пирогова Минздрава России
Россия

Туркина Татьяна Ивановна – доктор биологических наук, профессор кафедры клинической лабораторной  диагностики.

125412 Москва,  ул Талдомская, д.2.



В. С. Сухоруков
РНИМУ им. Н.И. Пирогова Минздрава России; Научный центр неврологии
Россия

Сухоруков  Владимир  Сергеевич  – доктор медицинских наук,  профессор,  заведующий лабораторией  Научного центра неврологии, профессор кафедры  гистологии, эмбриологии РНИМУ им. Н.И. Пирогова.

125412 Москва,  ул Талдомская, д.2.



Список литературы

1. Benjamin A., Michael M. Molecular nephropathology: ready for prime time? Am J Physiol Renal Physiol 2015; 309: F185– F188. DOI: 10.21508/1027-4065-2017-62-3-32-36

2. Морозов С.Л., Длин В.В., Сухоруков В.С., Воронкова А.С. Молекулярная нефропатология: новые возможности диагностики заболеваний почек. Российский вестник перинатологии и педиатрии 2017; 62(3): 32–36. DOI: 10.21508/1027-4065-2017-62-3-32-36

3. Mengel M., Campbell P.M., Gebel H., Randhawa P., Rodriguez E.R., Colvin R. et al. Precision diagnostics in transplantation: from bench to bedside. Am J Transplant 2013; 13: 562–568. DOI: 10.1111/j.1600-6143.2012.04344.x

4. Traitanon O., Poggio E., Fairchild R. Molecular monitoring of alloimmune-mediated injury in kidney transplant patients. Curr Opin Nephrol Hypertens 2014; 23: 625–630. DOI: 10.1097/MNH.0000000000000064

5. Sis B., Jhangri G.S., Bunnag S., Allanach K., Kaplan B., Halloran P.F. Endothelial gene expression in kidney transplants with alloantibody indicates antibody-mediated damage despite lack of C4d staining. Am J Transplant 2009; 9: 2312–2323. DOI: 10.1111/j.1600-6143.2009.02761.x

6. Hidalgo L.G., Sis B., Sellares J., Campbell P.M., Mengel M., Einecke G. et al. NK cell transcripts and NK cells in kidney biopsies from patients with donorspecific antibodies: evidence for NK cell involvement in antibody mediated rejection. Am J Transplant 2010; 10: 1812–1822. DOI: 10.1111/j.1600-6143.2010.03201.x.

7. Hidalgo L.G., Sellares J., Sis B., Mengel M., Chang J., Halloran P.F. Interpreting NK cell transcripts versus T cell transcripts in renal transplant biopsies. Am J Transplant 2012; 12: 1180–1191. DOI: 10.1111/j.1600-6143.2011.03970.x

8. Haas M., Sis B., Racusen L.C., Solez K., Glotz D., Colvin R.B. et al. Banff 2013 meeting report: inclusion of C4d-negative antibody-mediated rejection and antibody-associated arterial lesions. Am J Transplant 2014; 14: 272–283. DOI: 10.1111/ajt.12590

9. Geiss G.K., Bumgarner R.E., Birditt B., Dahl T., Dowidar N., Dunaway D.L. et al. Direct multiplexed measurement of gene expression with color-coded probe pairs. Nat Biotechnol 2008; 26: 317–325. DOI: 10.1038/nbt1385

10. Adam B., Afzali B., Dominy K.M., Chapman E., Gill R., Hidalgo L.G. et al. Multiplexed color-coded probe-based gene expression assessment for clinical molecular diagnostics in formalin-fixed paraffin-embedded human renal allograft tissue. Clin Transplant 2016; 30: 295–305. DOI: 10.1111/ctr.12689

11. Reis P.P., Waldron L., Goswami R.S., Xu W., Xuan Y., Perez-Ordonez B. et al. mRNA transcript quantification in archival samples using multiplexed, color-coded probes. BMC biotechnology 2011; 11: 46. DOI: 10.1186/1472-6750-11-46

12. Sánchez-Navarro I., Gámez-Pozo A., González-Barón M., Pin-to-Marín A., Hardisson D., López R. et al. Comparison of gene expression profiling by reverse transcription quantitative PCR between fresh frozen and formalin-fixed, paraffin-embedded breast cancer tissues. Biotechniques 2010; 48(5): 389–397. DOI: 10.2144/000113388

13. Pascoe C.D., Obeidat M., Arsenault B.A., Nie Y., Warner S., Stefanowicz D. et al. Gene expression analysis in asthma using a targeted multiplex array. BMC Pulmonary Medicine 2017; 17: 189. DOI: 10.1186/s12890-017-0545-9

14. Terakado M., Gon Y., Sekiyama A., Takeshita I., Kozu Y., Matsumoto K. et al. The Rac1/JNK pathway is critical for EGFR-dependent barrier formation in human airway epithelial cells. Am J Physiol Lung Cell Mol Physiol 2011; 300: 56–63. DOI: 10.1152/ajplung.00159.2010

15. Ong C.-T., Corces V.G. CTCF: an architectural protein bridging genome topology and function. Nat Rev Genet 2014; 15: 234–246. DOI: 10.1038/nrg3663

16. Youssef D.M., Elbehidy R.M., Abdelhalim H.S., Amr G.E. Soluble Interleukine-2 Receptor and MDR1 Gene Expression Levels as Inflammatory Biomarkers for Prediction of Steroid Response in Children With Nephrotic Syndrome. Iran J Kidney Dis 2011; 5(3): 154–161.

17. Хундерякова Н.В., Захарченко М.В., Ячкула Т.В., Плясунова С.В., Сухоруков В.С., Баранич Т.И. и др. Неповреждающие высокочувствительные цито²биохимические показатели состояния митохондрий у человека для клинических исследований. В книге: Теоретическая и экспериментальная биофизика. Материалы конференции, посвященной 65-летию ИТЭБ РАН. М., 2017; 43.


Для цитирования:


Морозов С.Л., Воронкова А.С., Длин В.В., Туркина Т.И., Сухоруков В.С. Анализ экспрессии генов по технологии nCounter Nanostring в медицинских исследованиях: опыт использования у детей с нефротическим синдромом. Российский вестник перинатологии и педиатрии. 2019;64(1):110-115. https://doi.org/10.21508/1027-4065-2019-64-1-110-115

For citation:


Morozov S.L., Voronkova A.S., Dlin V.V., Turkina T.I., Sukhorukov V.S. Analysis of gene expression by nCounter Nanostring technology in medical research: experience with children with nephrotic syndrome. Rossiyskiy Vestnik Perinatologii i Pediatrii (Russian Bulletin of Perinatology and Pediatrics). 2019;64(1):110-115. (In Russ.) https://doi.org/10.21508/1027-4065-2019-64-1-110-115

Просмотров: 206


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 1027-4065 (Print)
ISSN 2500-2228 (Online)